二甲医院开的病假条一般情况下公司是认可的，但具体情况还需结合公司规章制度和实际情况来判断，以下是相关分析：

法律依据

根据《企业职工患病或非因工负伤医疗期的规定》第三条规定，企业职工因患病或非因工负伤，需要停止工作医疗时，根据本人实际参加工作年限和在本单位工作年限，给予3个月到24个月的医疗期。一般情况下，二级甲等医院及以上的单位出具的诊断证明都应该被单位承认。

公司规章制度

• 合理规定 ：如果公司规章制度明确规定员工请病假需要提交二级甲等及以上医院的病假证明，且该制度经过民主程序制定并公示告知员工，那么公司按照制度执行不认可二甲以下医院的病假条是具有一定合理性的。

• 不合理规定 ：若公司制度规定必须是三甲医院的病假证明才认可，而员工因急诊等情况在二甲医院就医并开具病假条，这种情况下公司不认可二甲医院的病假条可能就不合理，因为法律鼓励就近就医，员工在这种情况下有权选择就近的医疗机构进行治疗。

病假条的有效性

• 医生资质 ：开具病假条的医生需要具有医师及以上职称且具备处方权，且医生只能给亲自诊治的病人开具病假条，并在病历、门诊登记表上做好记录以备核对。

• 医院公章 ：病假条必须经医务科加盖公章方才有效。

实际情况

• 病情严重程度 ：如果员工的病情较为严重，需要较长时间的治疗和休息，二甲医院的病假条通常会被公司认可。但如果员工的病情较轻，公司可能会对病假条的真实性产生怀疑，从而要求员工提供进一步的证明或到指定医院进行复查。

• 请假时间长短 ：对于较短时间的病假，如1-3天，二甲医院的病假条一般会被认可。但如果请假时间较长，如超过一周或更长时间，公司可能会要求员工到更高级别的医院进行复查，并提供更详细的病历和诊断证明。