要办理停掉农村合作医疗并让单位上社保，您可以按照以下步骤操作：
- 取消农村合作医疗 ：
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携带有效的身份证原件及复印件，到户籍所属的镇街农合办申请办理停保手续。
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可以选择到镇（街道）社保服务中心办理退保手续，并将材料报批至县社保中心农保科。
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如果新农合已启用社保卡，则需要同时注销社保卡。
- 办理社保关系转移 ：
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向市社保中心提出医疗保险关系转移申请，提供转出地经办机构出具的《参保（合）凭证》以及原参保地医疗保险缴费凭证，填写转移申请表。
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在市社保基金结算中心办理医疗保险关系和个人账户转移手续。
- 单位办理社保 ：
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在完成上述步骤后，您已经取消了农村合作医疗并办理了社保关系转移，接下来可以让单位为您办理社保。
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离职职工可到社保机构办理个人续保业务，需提供身份证、社保卡和银行账户。
- 注意事项 ：
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两个医保不能重复享受，因此在办理停保手续前，请确保已经了解并确认不再需要农村合作医疗。
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办理停保手续后，及时办理社保关系转移，以便能够顺利参加职工医保。
通过以上步骤，您就可以顺利办理停掉农村合作医疗并让单位上社保了。建议提前咨询当地社保机构或相关部门，了解具体的办理流程和所需材料，以确保办理过程顺利。