农村医疗保险（新农合）不能单独缴费的原因主要有以下几点：

1. 家庭筹资 ：新农合是由政府组织、引导、支持，农民自愿参加的制度，采取个人、集体和政府多方筹资的方式。这意味着参保费用通常需要由家庭共同承担，而不是个人单独缴纳。

2. 保险意识不足 ：许多农民对医疗保险的认知和了解程度较低，可能不清楚医疗保险的重要性或具体保障范围，导致他们不愿意购买或交不起保费。

3. 经济压力 ：农村地区的经济相对落后，许多农民的收入水平较低，难以承担医疗保险的保费。此外，他们还需要承担其他生活费用，如教育、医疗、养老等，这些压力可能使他们无法承担医疗保险的保费。

4. 保险产品不合适 ：市场上的医疗保险产品种类繁多，不同的保险产品可能有不同的保费和保障范围。如果农民选择的保险产品不适合他们的需求或保费过高，他们可能会觉得交不起保费。

5. 系统升级或中断 ：有时由于医保系统升级或之前中断过缴费，可能导致农民无法按时缴纳保费。

6. 政策鼓励而非强制 ：虽然国家鼓励农民缴纳医疗保险，但并没有强制要求。不过，如果家庭中有成员未缴纳，可能会影响其他已缴纳成员的报销权益。

综上所述，农村医疗保险不能单独缴费主要是由于家庭筹资、保险意识不足、经济压力、保险产品不合适、系统升级或中断以及政策鼓励而非强制等原因。建议政府和相关部门加强宣传和教育，提高农民的保险意识，同时优化保险产品，减轻农民的经济负担。