新农合（新型农村合作医疗）和市医保（城市居民医疗保险）的主要区别如下：
- 参保对象 ：
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新农合 ：主要针对农村户籍居民。
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市医保 ：主要覆盖城镇户籍居民，包括没有参加城镇职工医疗保险的未成年人和无工作的居民。
- 管理部门 ：
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新农合 ：多数地方由卫生部门管理。
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市医保 ：主要由人社部门管理。
- 缴费标准 ：
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新农合 ：缴费较低，一年通常只需几十块钱。
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市医保 ：缴费较高，通常与个人工资和当地平均工资挂钩。
- 报销比例 ：
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新农合 ：报销比例较市医保低，在三甲医院的报销比例通常为30%，但在农村乡镇医院的报销比例较高。
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市医保 ：报销比例较高，通常在50%左右，通过逐级转院可达70%。
- 保障待遇 ：
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新农合 ：主要保障住院费用，门诊待遇水平较高，特别是在乡镇医院。
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市医保 ：保障范围较广，包括门诊、住院及指定药店购买药品的费用，报销比例通常为85%。
- 整合情况 ：
- 新农合 和 市医保 ：目前已经在很多地区实现了整合，称为城乡居民基本医疗保险，覆盖范围、筹资政策、保障待遇等更加统一。
总结：
新农合和市医保在参保对象、管理部门、缴费标准、报销比例和保障待遇等方面存在明显差异。不过，随着政策的推进，新农合和城镇居民医保已经逐步整合为统一的城乡居民基本医疗保险，使得城乡居民在医疗保障上的待遇更加公平和一致。