如果您在农村合作医疗缴费时出现了重复缴费的情况，可以按照以下步骤进行处理：
- 确认重复缴费 ：
- 通过查询缴费记录或咨询当地农村合作医疗管理机构，确认是否存在重复缴费的情况。
- 提交退费申请 ：
- 若确认重复缴费，可向当地农村合作医疗管理机构提交退费申请。申请材料通常包括身份证明、缴费凭证（如收据、银行转账记录）以及退费申请表等。
- 等待审核与处理 ：
- 提交申请后，相关机构将对申请进行审核。审核通过后，将按照规定的程序和时间退还多余的费用。农民需保持联系方式畅通，以便及时接收退费通知。
- 保留一份保险 ：
- 若农民决定保留一份保险，需根据个人实际情况和需求进行选择。
- 联系当地医保局 ：
- 也可以直接联系所在地的农村合作医疗保险管理部门（如医保局），向其说明重复缴费的情况，并咨询退费的具体流程和要求。
- 准备相关材料 ：
- 根据医保局的要求，准备相关的身份证明、缴费凭证、银行账户信息等材料。这些材料将用于核实个人身份和缴费情况，确保退费过程的顺利进行。
- 寻求法律帮助 ：
- 若重复缴费金额较大，或申请退费过程中遇到阻碍，表明问题比较严重，应及时寻求法律专业人士的进一步帮助。
通过以上步骤，您可以有效地处理农村合作医疗重复缴费的问题，并确保您的权益不受损害。