农村合作医疗社会保障卡的补办流程如下：

1. 预挂失 ：

• 医疗保险卡丢失后，应先进行预挂失。预挂失可以通过口头或书面方式办理，有效期为10天。超过有效期后，挂失会自动解挂，社保卡恢复使用。如果需要紧急就医，可以到本市任意的社保卡服务网点办理撤销挂失手续。

2. 正式挂失 ：

• 预挂失后，需要进行正式挂失。正式挂失手续应由本人办理，特殊情况如行动不便、高龄等可委托他人代办。挂失人需出示本人身份证，委托他人代办时，还需提供被委托人的身份证原件与复印件。

3. 办理补卡手续 ：

• 在正式挂失的同时，办理补卡手续。当场填写申请单，交给社保卡服务网点工作人员办理后开具领卡证明。该证明可作为补卡人补卡期间的临时就医凭证。

4. 领取新卡 ：

• 15个工作日后，补卡人持本人的身份证和领卡证明到社保卡服务网点领取新卡。

5. 异地补办 ：

• 如果需要异地补办社保卡，不需要回当地办理。只需携带本人的身份证，就可以在本地社保局现场进行补办。

建议：

• 在补办前，建议先电话或网上预约挂失，以节省时间。

• 如果特殊情况需要代办，务必提前准备好委托书和双方身份证原件及复印件。

• 补办后，建议及时到社保中心办理报销手续，以免影响医疗费用的报销。