特殊门诊报销是否有上限，取决于具体的地区政策、病种以及医保类型。以下是一些具体情况：
有报销上限的情况
按病种设置上限 ：许多地区对不同特殊门诊病种设置了明确的年度报销上限。如南京市规定，恶性肿瘤门诊放化疗基金支付限额为 15 万元 / 年，器官移植术后抗排异治疗抗排异药物治疗基金支付限额为 8 万元 / 年；武汉市居民医保支气管哮喘疾病年度支付限额为 5600 元，职工医保年度支付限额为 7000 元。
不同医保类型上限不同 ：通常职工医保和居民医保的报销上限有所差异，且职工医保的标准一般高于居民医保。如在广州市，职工医保的门诊特殊疾病报销额度相对较高，而居民医保的报销额度则相对较低。
无报销上限或上限较高的情况
部分病种不设上限 ：有些地区的某些特殊门诊病种不设报销上限，如福建省福州市的高血压特殊病种，年度最高支付限额 6000 元，但这是在普通门诊和特殊门诊起付线合并计算的情况下，如果按照特殊门诊待遇执行，报销额度会更高。
与住院共用封顶线 ：有些地区的特殊门诊报销与住院报销共用一个封顶线，如福建省福州市的恶性肿瘤化学治疗和放射治疗特殊病种，年度最高支付限额提高至特殊门诊的 120000 元（与住院共用封顶线）。