通常不会被开除
员工患有乙肝小三阳 通常不会被公司开除 。根据《中华人民共和国劳动合同法》第四十二条的规定，员工在患病或者非因工负伤的情况下，在规定的医疗期内，用人单位不得通过无过失性辞退或者经济性裁员单方面解除劳动合同。此外，如果员工的医疗期内用人单位违法解除劳动合同，劳动者可以要求用人单位继续履行或者按经济补偿标准的两倍支付赔偿金。
具体参考以下法律条款：
- 《中华人民共和国劳动合同法》第四十二条：劳动者有下列情形之一的，用人单位不得依照本法第四十条、第四十一条的规定解除劳动合同：
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（一）从事接触职业病危害作业的劳动者未进行离岗前职业健康检查，或者疑似职业病病人在诊断或者医学观察期间的；
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（二）在本单位患职业病或者因工负伤并被确认丧失或者部分丧失劳动能力的；
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（三）患病或者非因工负伤，在规定的医疗期内的；
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（四）女职工在孕期、产期、哺乳期的；
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（五）在本单位连续工作满十五年，且距法定退休年龄不足五年的；
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（六）法律、行政法规规定的其他情形。
- 《中华人民共和国劳动合同法》第四十条：有下列情形之一的，用人单位提前三十日以书面形式通知劳动者本人或者额外支付劳动者一个月工资后，可以解除劳动合同：
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（一）劳动者患病或者非因工负伤，在规定的医疗期满后不能从事原工作，也不能从事由用人单位另行安排的工作的；
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（二）劳动者不能胜任工作，经过培训或者调整工作岗位，仍不能胜任工作的；
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（三）劳动合同订立时所依据的客观情况发生重大变化，致使劳动合同无法履行，经用人单位与劳动者协商，未能就变更劳动合同内容达成协议的。
因此，如果员工患有乙肝小三阳且肝功能正常，公司通常不能以此为由解除劳动合同。如果公司违反相关法律规定，员工可以向劳动监察大队投诉或者申请劳动仲裁，要求公司继续履行合同或者支付相应的经济赔偿金。