在寻找黔西南地区治疗线粒体病的医院时，以下医院因其专业的医疗团队和先进的医疗设备而被认为是较好的选择：

贵州省人民医院

• 地址：贵州省贵阳市南明区中山东路83号
• 擅长疾病：癫痫、睡眠障碍、老年认知障碍性疾病等

遵义医科大学附属医院

• 地址：贵州省遵义市大连路149号
• 擅长疾病：白内障、鼻咽癌、病毒性肝炎等

贵州中医药大学第二附属医院

• 地址：贵州省贵阳市南明区东新区路72号
• 擅长疾病：骨科、妇科、儿科等

黔南州人民医院

• 地址：贵州省都匀市文峰路9号
• 擅长疾病：白内障、胆结石、胆管炎等

贵阳市第一人民医院

• 地址：贵州省贵阳市南明区博爱路97号
• 擅长疾病：鼻息肉、鼻中隔偏曲、癫痫等

请注意，医院排名可能会随时间变化，建议您在就诊前进行进一步的核实和咨询。