省内跨市医保备案一般是可以办理的，但如果遇到不能备案的情况，可能存在以下原因：
政策差异方面
统筹区政策不同：基本医疗保险实行市级统筹，不同统筹区的医保政策、待遇标准等可能存在差异，导致部分地市之间在备案政策上存在不统一的情况。例如，有些地区可能对备案的人员类型、备案材料、备案流程等有特殊要求，不符合这些要求就无法备案。
政策调整过渡期：医保政策可能会根据实际情况进行调整和优化，在政策调整的过渡期内，可能会出现备案系统尚未更新完善，或者新旧政策衔接不畅等问题，影响参保人员的备案办理。
信息系统方面
系统不稳定或故障：医保信息系统的运行可能会受到网络、服务器等技术因素的影响，出现系统不稳定或故障的情况，导致备案信息无法正常提交、传输或处理。例如，在系统升级、维护期间，备案功能可能会暂时关闭或出现异常。
数据更新不及时：参保人员的医保信息需要在不同统筹区之间进行共享和更新，如果数据更新不及时，可能会导致备案时信息不一致或缺失，影响备案结果。
个人方面
参保状态不正常：如果参保人员的医保处于断缴、停保等不正常状态，可能无法进行跨市医保备案。因为医保备案的前提是参保状态正常，能够正常享受医保待遇。
备案材料不齐全或不符合要求：不同地区对于医保备案所需的材料可能有不同的规定，如果参保人员提交的备案材料不齐全、不符合要求，或者材料的真实性、有效性存在问题，也会导致备案不成功。
未选择正确的备案渠道：参保人员需要通过参保市经办机构窗口或参保市公布的小程序、手机APP、网站、电话（传真）等渠道办理跨市就医备案。如果选择了错误的备案渠道，可能会导致备案信息无法被正确接收和处理。