全国治疗癫痫的知名医院包括：

1. 北京协和医院 ：北京协和医院神经科是中国神经专科的佼佼者，拥有深厚的学术背景和丰富的临床经验，连续多年获得神经内科专科声誉排行榜前列。

2. 复旦大学附属华山医院 ：复旦大学附属华山医院神经内科是上海市医学领先专业重点学科，拥有专业的医疗团队和先进的医疗设备，在癫痫等神经系统疾病的诊断和治疗方面具有较高的水平。

3. 四川大学华西医院 ：四川大学华西医院神经内科是西南地区神经系统疾病疑难重症的诊治中心，拥有丰富的临床经验和国际一流的诊治技术，在癫痫的诊治方面具有较高的知名度和影响力。

4. 南宁脑博仕医院 ：南宁脑博仕医院是一家经卫生机构批准认可的专业医院，在癫痫的治疗方面具有较高的水平。

5. 北大妇儿医院（第一医院）、北京市儿童医院、北京市儿研所 ：这些医院在小儿癫痫的治疗效果很好。

6. 北京华信医院、中国医科大学航空总医院、北京市三博脑科医院、北京市宣武医院、北京市天坛医院、北京市海淀医院 ：这些医院在癫痫病外科手术治疗效果不错，有专门的独立癫痫病病区。

7. 广州三九脑科医院 ：在癫痫病外科手术治疗方面也有很好的效果。

8. 武汉癫痫病专科医院、武汉癫痫病医院、武汉中际癫痫病医院 ：这些医院在癫痫病的治疗方面较为专业，技术水平较高。

这些医院在癫痫病的诊断和治疗方面都有较高的声誉和专业水平，患者可以根据自己的地理位置和具体需求选择合适的医院进行治疗。建议患者在选择医院时，可以综合考虑医院的学术背景、临床经验、医疗设备以及患者评价等因素。