合作医疗一般情况下是可以报销 CT 检查费用的，但存在一定的限制条件，具体如下：
报销范围与限额
门诊报销 ：在一些地区，合作医疗的门诊报销范围包括 CT 检查，但通常会有一定的报销限额。例如，有的地区规定在乡镇卫生院就诊时，每次就诊各项检查费及手术费限额 50 元，处方药费限额 100 元；在二级医院就诊时，每次就诊各项检查费及手术费限额 50 元，处方药费限额 200 元；在三级医院就诊时，每次就诊各项检查费及手术费限额 50 元，处方药费限额 200 元。
住院报销 ：合作医疗的住院报销范围一般包含 CT 检查费用，但同样会有一定的限额。如新农合住院报销标准中规定，药费、辅助检查项目如心脑电图、X 光透视、拍片、化验、理疗、针灸、CT、核磁共振等各项检查费限额 200 元。
报销比例
门诊报销比例 ：不同地区、不同级别的医疗机构，合作医疗的门诊报销比例有所不同。一般来说，村卫生室、卫生所报销比例 60%；镇卫生院报销比例 40%；二级医院报销比例 30%；三级医院报销比例 20%。
住院报销比例 ：住院报销比例也因地区和医院级别而异。例如，镇卫生院报销 60%；二级医院报销 40%；三级医院报销 30%。
报销流程
在医院报销 ：患者可以在医院就诊后，将合作医疗卡和 CT 检查费用一起交给医院的财务部门，由医院代为报销。
门诊报销 ：如果患者是门诊就诊，可以将收据和合作医疗卡一起到社区卫生服务中心进行报销。
