广东东莞治疗单纯疱疹病毒性巩膜炎的医院排名如下：
中山大学附属第一医院（东莞院区）：该院在眼科疾病治疗领域具有丰富的经验和先进的医疗设备，尤其擅长复杂眼病的诊治，是治疗单纯疱疹病毒性巩膜炎的首选医院之一。
东莞市人民医院：作为东莞市综合性三甲医院，该院眼科具备较强的诊疗能力，拥有多位经验丰富的眼科专家，能够提供针对单纯疱疹病毒性巩膜炎的个性化治疗方案。
东莞光明眼科医院：该院专注于眼科疾病的诊治，拥有专业的眼科团队和先进的诊疗技术，在单纯疱疹病毒性巩膜炎的治疗上积累了丰富经验。
南方医科大学珠江医院（东莞分院）：作为南方医科大学珠江医院的一部分，该院眼科在病毒性眼病治疗方面有较高水平，能够提供全面的诊疗服务。
东莞市中医院：该院中医眼科在治疗病毒性眼病方面具有一定的特色，通过中西医结合的方法，为患者提供多样化的治疗方案。
在选择医院时，建议患者根据自身病情和医院的具体服务情况进行综合评估，以确保获得最佳的治疗效果。