南京治疗脑梗最好的医院排名如下（综合权威性、学科实力及临床经验）：
南京市中医院
作为中医特色医院，结合中西医结合治疗脑梗，拥有国家级名中医团队和丰富的康复经验。
南京鼓楼医院
综合性三级甲等医院，拥有9个国家临床重点专科（含神经内科），诊疗设施完善，内科疾病治疗经验丰富。
东南大学附属中大医院
国家临床重点专科重症医学科、医学影像学，神经内科为省级临床重点专科，科研实力强。
江苏省人民医院
三级甲等综合性医院，心血管病学国家重点学科，疾病诊疗设施齐全，综合实力突出。
南京医科大学第二附属医院
省级临床重点专科神经内科（建设单位），多学科协作能力强，治疗经验丰富。
其他推荐 ：
南京脑科医院 ：专注脑血管疾病诊疗，技术先进。
南京江北医院卒中中心 ：急性脑梗救治成功率突出，多学科协作高效。
建议优先选择综合实力强、神经内科为省级重点专科的医院，并根据病情选择急性期溶栓或介入治疗等方案。