新疆的二级医院包括但不限于以下几家：

1. 新疆维吾尔自治区人民医院米东医院 ：隶属于自治区人民医院直接管理，是一所集医疗、预防保健、"120"院前急救、健康教育和社区卫生服务为一体的综合性二级医院。

2. 乌鲁木齐市温泉疗养院温泉医院 ：位于乌鲁木齐市温泉西路，是一家二级丙等综合医院。

3. 新疆交通医院 ：位于乌鲁木齐市阿勒泰路，是一家二级乙等综合医院。

4. 阿勒泰地区哈医医院 。

5. 阿勒泰市人民医院 。

6. 伊犁哈萨克自治州精神病院 。

7. 神农中医院 。

8. 新疆医科大学中医学院直属医院 ：位于乌鲁木齐市鲤鱼山南路，是一家公立医院，擅长多个科室。

9. 库车县第二人民医院 ：位于阿克苏地区库车市英阿瓦提南路，是一家公立医院。

10. 阿克苏地区中医医院 ：位于阿克苏地区阿克苏市晶水路，是一家公立医院。

11. 新疆医科大学第六附属医院（新疆骨科医院） 。

12. 乌鲁木齐市第一人民医院（儿童医院） 。

13. 乌鲁木齐市安宁医院（乌市精神病福利院） 。

14. 库尔勒市第一人民医院 ：位于孔雀河畔团结北路，是一家集医疗、教学、科研、预防、保健、康复为一体的二级甲等综合医院。

15. 新疆兵团农一师医院 ：位于新疆阿克苏市，是一所现代化的二级甲等医院。

16. 新疆宝石花医院 ：是中国通用技术宝石花医疗下属的央企医疗机构，是一家设备先进、专科齐全、特色鲜明、环境优美的综合医院。

17. 中国人民解放军第二七三医院 ：位于新疆巴音郭楞州库尔勒市铁门关路，拥有心血管病、心胸肝胆外科、眼科等特色专科。

18. 新疆伊犁新源县人民医院 ：位于新疆伊犁州新源县卡普河路，拥有心血管内科、神经外科等特色专科。

19. 新疆兵团农四师医院 ：位于新疆伊犁州伊宁市新华西路，拥有针灸科、眼科、口腔科等特色专科。

20. 叶城县人民医院 。

这些医院在各自的地区和专科领域内具有一定的影响力和优势。建议您根据具体需求和地理位置选择合适的医院进行就诊。