60%

农村合作医疗（新农合）的手术住院报销比例如下：

1. 镇卫生院 ：报销比例为60%。

2. 二级医院 ：报销比例为40%。

3. 三级医院 ：报销比例为30%。

需要注意的是，这些比例是基于不同医院的等级，并且并不是所有的医疗项目都按照这个比例来报销。具体的报销比例和金额还受到当地实际标准和政策的限制。如果是在镇级合作医疗住院及尿毒症门诊血透、肿瘤门诊放疗和化疗，每年还可限额补偿1.1万元。

建议：

• 在选择医院就诊时，了解当地的具体报销政策和标准，以便更好地利用新农合进行报销。

• 保留好所有的住院资料和相关的发票，以便在需要时进行报销。