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合作医疗异地就医是可以报销的 。根据国家相关法律法规规定，参保人员在异地就医时，其医疗费用在出院结算时可以由基本医疗保险基金支付，并且参保人还可以选择二次报销。

具体报销流程如下：

1. 医院提供结算单和住院明细等材料 ，并垫付新农合报销费用，同时留存发票原件。

2. 患者出院时，在新农合直接结报服务窗口享受结报服务，并缴纳自付费用。

3. 对于无法在省级医疗机构确诊或确诊后无治疗条件的疑难病症患者，可以在住院前向参合地经报机构申请办理跨省就医转诊。

需要注意的是，不同地区的医保政策可能存在差异，因此建议患者在住院前先咨询当地医保管理部门，了解具体的报销政策和流程，以确保顺利享受基本医疗保险待遇。