是的
农村合作医疗的报销流程是先自费后报销。参保农民在住院治疗时，需要先支付医疗费用，然后在出院时根据新农合的报销比例进行报销。报销后的资金会打入个人的保障卡中。
详细报销流程如下：
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住院费用支付 ：参保农民在定点医疗机构住院时，需要先支付医疗费用，包括住院押金等。
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报销申请 ：出院时，参保农民需要携带相关证件（如户口本、身份证、新农合参合缴费票据、住院发票、诊断证明、费用清单、住院病历等）到定点医疗机构的医保窗口或合管办进行报销申请。
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报销审核 ：合管办或医保窗口会对提交的材料进行审核，确认报销资格和金额。
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报销资金划拨 ：审核通过后，报销资金会直接划拨到参保农民的个人保障卡中，或者由定点医疗机构先行垫付，再通过合管办进行结算。
需要注意的是，报销比例和金额会根据当地政策和参保农民的个人情况有所不同。新农合基金主要补助参加新型农村合作医疗农民的大额医疗费用或住院医疗费用，有条件的地方可实行大额医疗费用补助与小额医疗费用补助结合，提高抗风险能力兼顾农民受益面。
建议参保农民在住院前了解当地的报销政策和流程，确保能够顺利享受到医保待遇。