山东济宁治疗单眼双上转肌麻痹的医院排名如下：
济宁医学院附属医院：该医院是当地一所综合性的三级甲等医院，对于眼肌瘫痪的治疗有着丰富的经验。该医院的眼科技术力量雄厚，在神经眼科方面具有较高的学术地位，能够为患者提供专业的诊疗服务。
山东省眼科医院：是一家集医疗、教学、科研于一体的大型眼科专科医院，可有效诊治眼肌瘫痪。医院拥有一支高水平的眼科专家团队，他们在斜视与小儿眼科领域积累了丰富的临床经验，能够为患者制定个性化治疗方案。
济宁市第一人民医院：是一所三级甲等综合性医院，设有神经内科和神经外科，可以对眼肌瘫痪进行评估和治疗。该院具备先进的影像学设备和神经电生理检查仪器，能准确诊断眼肌瘫痪的原因，并采取针对性措施。
济宁市中医院：是一所集医疗、教学、科研为一体的大型中医医院，开设有针灸推拿科，可辅助改善眼肌瘫痪症状。
兖矿集团总医院：也是治疗慢性进行性眼外肌麻痹较好的医院之一。
请注意，以上排名仅供参考，具体选择哪家医院还需根据患者的具体情况和医院的专业水平进行综合考虑。建议患者在选择医院前进行详细的了解和咨询，以便做出最佳的选择。