手指肉里长透明小水泡、很痛可能是因为湿疹、汗疱疹、手癣等原因引起，需要针对引发的原因采取局部用药或口服用药治疗。

1、湿疹：湿疹属于一种慢性皮肤疾病，由多种内外在因素而引起的病变，可发生在身体的多个部位，当湿疹累及到手部时，则会引起手指肉里长透明小水泡、很痛，同时还伴有不同程度的瘙痒、渗出等症状。出现水泡无渗出者，可以局部涂抹丙酸氯倍他索软膏、糠酸莫米松软膏等，若伴有渗出者，可以给予冷湿敷治疗，比如3%的硼酸溶液、0.1%的依沙丫啶溶液，必要时还可以同时口服氯雷他定片、西替利嗪片等药物治疗。

2、汗疱疹：是发生在手足部位的水疱性皮肤疾病，发病原因与精神因素、过敏、皮肤癣菌感染有关，以水疱、瘙痒为主要特征，由于疾病反复发作，所以会引起手指长透明水泡、很痛。需要做好手部的护理措施，避免对手部造成摩擦，以免水泡破裂后，出现继发性感染，还可以局部涂抹水杨酸软膏、尿素霜等药物，亦或者口服氯雷他定片、泼尼松片治疗。

3、手癣：是由皮肤癣菌感染而引起的皮肤病变，发病原因与直接接触或间接接触患者所使用的物品有关，以干燥、水疱、脱屑为主要特征，由于疾病反复发作，使局部的皮损较为严重，所以会引起手指头长水泡、很痛。一般可以给予外用药物涂抹治疗，比如克霉唑软膏、酮康唑乳膏等，局部用药不佳者，还可以口服伊曲康唑胶囊、特比萘芬片治疗。

手指头长水泡很痛的患者，短时间内尽量不要接触刺激性的物品，比如肥皂、洗洁精、洗衣液等，以防这些物质对皮肤造成刺激，使病变更加严重。