大三阳的临床症状与患者病程阶段有关。如果大三阳患者为携带者阶段，患者可没有明显不适表现，在临床症状上与正常人无明显差异，一般只能通过血液乙肝病毒标志物检测明确诊断。
如果大三阳患者存在近期活动性肝损伤，可表现出食欲减低、厌油、精神状态变差等全身症状，同时可出现腹胀、右上腹疼痛等局部症状。
如果活动性肝损伤程度较重，可合并黄疸等，一般肝功能检查可发现转氨酶以及胆红素水平升高。
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