血肌酐升高的原因是与肾功能不全有关系。也就是当肾功能不全的时候，肾小球滤过率下降，血肌酐作为一种小分子毒素物质，不能够充分的滤过进入尿液中排除体外。
肾功能不全分为急性和慢性，急性因素中主要是与肾毒性药物的应用，或者各种生物毒素、长时间肾脏缺血，从而导致急性肾小管坏死。当肾结石引起泌尿系统完全梗阻的时候，也会导致血肌酐升高。
在慢性因素中，主要有糖尿病肾病、肾小球肾炎等，遗传性的肾脏疾病中，多囊肾也是引起慢性肾功能不全常见的原因。
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