窦性心律失常，如为生理性病因导致，只需观察或对症治疗即可。如果是病理性原因引起，则需要针对原发病进行治疗。
对于生理性窦性心动过速，可使用物理方法使窦性心动过速逐渐减慢。继发性窦性心动过速，消除病因后多可缓解，必要时可在医生处方下给予β受体阻滞剂或非二氢吡啶类钙通道阻滞剂等治疗。
生理因素引起的窦性心动过缓多不需治疗，若患者无心动过缓相关症状，亦可先定期随访观察。对于有症状的窦性心动过缓，患者应针对病因治疗，必要时使用药物。若药物治疗后症状仍未改善，应考虑安装心脏起搏器。
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