新生儿时期吃益生菌的类型，主要和新生儿疾病有关系。
新生儿坏死性小肠结肠炎，可以使用综合治疗，益生菌有益于预防及治疗，可以降低早产儿的发生率及病死率，推荐使用双歧杆菌三联活菌散、酪酸梭菌活菌散剂、布拉氏酵母菌等。
新生儿黄疸，可以使用枯草杆菌二联活菌颗粒、地衣芽孢杆菌活菌颗粒、布拉氏酵母菌、双歧杆菌四联活菌片等。
对于早产儿喂养不耐受时，推荐使用双歧杆菌乳杆菌三联活菌片、双歧杆菌三联活菌散。
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