蛋白S的活性检测属于生理性抗凝因子的检查。许多常见的疾病，如肝病、肾病、心脑血管疾病等等，都会影响血液中蛋白S的活性。因此，测定血清中蛋白S的活性，对上述疾病的预防、诊断，观察病情以及判断预后都有重要的价值。
但是蛋白S检测，一般与其他检测血液高凝状态的检查一起进行，用于筛查凝血因子活性是否正常，如活性减低提示存在相关抗凝血因子水平的异常，可能为易栓症。目前对于蛋白S引起的胚胎停育的具体数值，没有明确的规定。
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