根据每个人胃肠道的结构不一样，所以检查的时间也不完全一样。一般情况下是在半个小时到一个小时之间，而且还跟是否有做镜下治疗有关。
如果只是单纯的胃肠镜检查，胃镜一般5-10分钟左右，肠镜的检查一般是在20-30分钟左右，整体的检查时间一般在一个小时之内。
如果患者肠道有形态异常，比如结肠冗长、便秘、腹部手术史的患者，肠镜检查的时间会相应的延长。如果需要做镜下治疗，也会相应的延长。
如果要做麻醉胃肠镜的检查，因为需要麻醉的时间也会相应的延长，所以胃肠镜检查时间不一定，一般在半个小时到一个小时之间。
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