小儿癫痫病的病因第一是遗传,染色体或者基因的缺陷可以造成癫痫。第二是代谢,比如低血糖或者遗传代谢病,甲基丙二酸等类似的遗传代谢病都可以造成癫痫。第三是结构,比如孩子有皮层的发育不良,包括脑炎继发的结构异常都可以造成癫痫。第四是感染,主要是中枢神经系统的感染,包括细菌、病毒以及寄生虫都可以造成继发的癫痫。第五是免疫,最主要的是自身免疫性癫痫,免疫因素也是癫痫的病因。第六,还有一些找不到明确的原因。
儿童的癫痫病因相对比较复杂,包括遗传、结构、代谢、感染、免疫以及未知的病因,2017年国际抗癫痫联盟新的癫痫分类和术语的指南把儿童癫痫的病因分为六大类。