进行头颅核磁检查的时候，首先要确保没有磁共振检查的禁忌症，比如装有人工心脏瓣膜、心脏起搏器、颅内做手术时留有动脉瘤夹、人工胰岛素泵等金属或者电子类的人工植入物。在检查前请务必向临床医师和磁共振医师声明，以确保能安全检查。
进行磁共振检查前，要摘掉活动假牙、身上的金属物品和电子物品比如银行卡、钥匙、手机等等，才能安全地进行检查。在磁共振检查过程中要闭上眼睛，噪音和震动都是正常现象，不要过度紧张。检查过程大概需要10分钟，检查完后在工作时间内3小时就会拿到检查结果。
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