造成补体C3降低的原因有几种：
第一，感染类的疾病，比方链球菌感染。所谓的链球菌感染主要的症状有发热、咽痛、嗓子疼或扁桃腺发炎，链球菌感染会造成补体的降低，无论是C3还是C4，都有可能出现降低的情况。
第二，自身免疫性的疾病，比方系统性红斑狼疮，很容易出现补体的降低，而且补体降低的程度是非常显著的。
第三，其他的自身免疫病，包括IgG4相关疾病，也会出现补体的降低，而且补体可以降低的程度非常高。
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