新疆阿克苏社保基数16800的情况下，公司需要承担的费用大约在4704元至5712元之间，具体金额取决于各项社保的缴费比例。以下是详细的费用构成和影响因素：

1. 1.养老保险：养老保险的缴费比例通常为单位16%，个人8%。以16800元为基数，公司需要承担的费用为16800元×16%=2688元。
2. 2.医疗保险：医疗保险的缴费比例一般为单位8%，个人2%。公司需要承担的费用为16800元×8%=1344元。还有大病医疗保险，缴费比例一般为0.5%至1%，具体比例视当地政策而定。
3. 3.失业保险：失业保险的缴费比例一般为单位0.5%，个人0.5%。公司需要承担的费用为16800元×0.5%=84元。
4. 4.工伤保险：工伤保险的缴费比例根据行业风险程度有所不同，一般在0.2%至1.9%之间。假设按0.5%计算，公司需要承担的费用为16800元×0.5%=84元。
5. 5.生育保险：生育保险的缴费比例一般为单位0.8%，个人不缴费。公司需要承担的费用为16800元×0.8%=134.4元。
6. 6.住房公积金：住房公积金的缴费比例一般为单位和个人各12%。公司需要承担的费用为16800元×12%=2016元。

综合以上各项，公司在新疆阿克苏地区为员工缴纳社保的总费用大约为2688元（养老保险） + 1344元（医疗保险） + 84元（失业保险） + 84元（工伤保险） + 134.4元（生育保险） + 2016元（住房公积金） = 5350.4元。

需要注意的是，具体的缴费比例可能会根据当地政策的变化而调整，因此公司应定期关注最新的社保政策。部分地区可能会对社保基数设定上下限，如果员工的实际工资低于或高于社保基数的下限或上限，则按照下限或上限进行缴费。

在新疆阿克苏社保基数为16800元的情况下，公司需要承担的费用大致在4704元至5712元之间，具体金额需根据各项社保的缴费比例和当地政策进行计算。公司应密切关注政策变化，以确保合规缴纳社保费用。