宫外孕手术后补领结婚证是完全合法且具有同等法律效力的，但需注意医疗证明与婚姻登记程序的衔接以及生育津贴申领材料的完整性。手术记录与住院病历是补证过程中的核心材料，建议优先通过民政部门官网预约登记，确保材料一次性通过审核。

1. 法律依据与登记流程
   根据《婚姻登记条例》规定，补领结婚证无需重复提交婚前医学检查证明，但需提供双方身份证、户口簿原件及原结婚证遗失声明。宫外孕手术后的医疗记录（如出院小结、诊断证明）可作为补充材料提交民政部门存档备案，不影响婚姻关系合法性。

2. 特殊情况材料准备
   若因宫外孕治疗导致原结婚证丢失，除常规补证材料外，还需携带医院开具的手术情况说明（含手术时间、诊断结论等）。部分省市要求补充配偶知情同意书，需提前通过民政服务热线确认属地要求。

3. 生育权益关联事项
   补证后若涉及生育保险报销或津贴申领，需确保新结婚证登记日期与手术时间逻辑一致。例如2025年多地实行生育津贴“即申即享”政策，需同步上传补领的结婚证电子版至医保经办系统，避免因材料时间冲突影响审批。

建议术后优先完成结婚证补领手续，并留存至少2份复印件用于医疗报销、商保理赔等场景。如遇户籍地与实际手术地不一致的情况，可通过国家政务服务平台“跨省通办”模块提交申请，减少往返奔波。