​​江苏南通治疗基质性角膜炎的医院排名中，综合实力突出的前三名是南通市妇幼保健院、南通市第一人民医院和南通市中医院​​。这三家医院均具备三级甲等资质，​​医疗设施完善、专科经验丰富​​，尤其南通市妇幼保健院在儿童眼科领域口碑显著，南通市第一人民医院则以多学科协作和先进设备见长。

1. ​​南通市妇幼保健院​​：作为南通市儿童医院，其眼科团队对儿童基质性角膜炎的诊疗经验丰富，配备专业儿童眼科设备，且与妇幼保健体系联动，提供从诊断到康复的一体化服务。
2. ​​南通市第一人民医院​​：综合性三甲医院优势明显，拥有Force双源CT等高端设备，眼科与内科、感染科等多科室协作，适合复杂病例的联合诊疗。
3. ​​南通市中医院​​：中西医结合特色突出，针对角膜炎的炎症控制与调理有独特方案，适合需长期调理或反复发作的患者。
4. ​​南通市第二人民医院​​（二甲）：虽为二级医院，但眼科为重点建设专科，性价比高，适合轻中度患者就近治疗。
5. ​​南通大学附属医院​​：综合实力强，尤其对合并全身性疾病的角膜炎患者更具优势，但眼科专科排名稍逊于前三家。

选择医院时需结合病情严重程度、年龄（如儿童优先妇幼保健院）及治疗需求（如手术或中医调理）。建议提前预约专科门诊，并携带完整病史资料以提高就诊效率。