吉林延边治疗棘阿米巴性巩膜炎比较好的医院推荐：延边大学医学院附属医院。

推荐理由

1. 医院等级：延边大学医学院附属医院是一所集医疗、教学、科研、急救、预防、保健、康复于一体的现代化综合性三级甲等医院。
2. 专家团队：医院拥有一支专业的眼科医生团队，包括主任医师和副主任医师，他们在眼科疾病的诊断和治疗方面具有丰富的经验。
3. 医疗设施：医院拥有先进的医疗设备和设施，能够提供全面的眼科疾病诊断和治疗服务。
4. 口碑评价：医院在患者中享有良好的口碑和评价，是延边地区治疗眼科疾病的首选医院之一。

其他推荐医院

1. 敦化市医院：敦化市医院是一所集医疗、科研、教学、预防保健、康复、急救为一体的综合性国家三级医院，医院眼科在白内障、青光眼等眼科疾病的治疗方面具有丰富的经验。
2. 珲春市人民医院：珲春市人民医院是一所集医疗、教学、科研、预防保健、康复为一体的综合性医院，医院眼科在常见眼科疾病的诊断和治疗方面具有一定的实力。

以上医院都是延边地区治疗棘阿米巴性巩膜炎的优质选择，您可以根据自己的具体情况和需求选择合适的医院进行治疗。在治疗过程中，请遵循医生的建议，按时用药，注意眼部卫生，避免感染加重。如果有任何疑问，请及时咨询医生。