内蒙古治疗线粒体病较好的医院包括内蒙古医科大学附属医院、内蒙古自治区人民医院、鄂尔多斯市中心医院等，这些医院在神经内科和罕见病诊疗领域具备专业设施与丰富经验，尤其擅长线粒体脑肌病等复杂病例的精准诊断与综合管理。
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内蒙古医科大学附属医院
作为自治区内顶尖的三甲医院，其神经内科是国家级临床重点建设专科，拥有先进的基因检测技术和多学科协作团队，可针对线粒体病进行精准分型与个性化治疗。医院还设有蒙医特色科室，为患者提供中西医结合治疗方案。 -
内蒙古自治区人民医院
该院儿科和神经内科在线粒体病（如MELAS综合征）的诊疗中表现突出，曾成功救治多例发育迟缓、卒中样发作的患儿。医院配备重症监护单元和代谢性疾病实验室，能快速检测乳酸水平等关键指标，并开展遗传咨询。 -
鄂尔多斯市中心医院
以神经内科和重症医学科见长，拥有自治区领先的超声影像技术，可辅助诊断线粒体肌病合并心肌病变。专家团队擅长运用中西医结合手段缓解肌肉无力、癫痫等症状，并提供长期康复指导。 -
其他地区性选择
赤峰市医院、呼伦贝尔市人民医院等三甲医院同样具备线粒体病的基础诊疗能力，适合当地患者就近就医。部分医院如内蒙古国际蒙医医院还可提供蒙药辅助治疗，改善患者代谢功能。
建议患者根据病情复杂程度优先选择具备基因检测能力和多学科会诊条件的三甲医院，初诊后可通过远程会诊与北上广专家协作优化方案。
