​​慢特病和特药申请通常不冲突，但需根据当地政策区分报销路径，且同一药品不可重复报销。​​

慢特病和特药可同时申请，但报销规则不同。​​慢特病指需长期管理的慢性疾病​​（如高血压、糖尿病），报销侧重门诊费用减免；​​特药则是针对高费用重疾的特效治疗药物​​（如抗癌靶向药），需单独申报且报销比例更高。多数地区支持两类待遇叠加，但需注意：特药费用若已通过“双通道”或特殊渠道结算，普通门诊慢特病报销不再重复覆盖。例如，宜川县明确要求特药申报独立于慢特病病种限额，需单独审批。

具体操作中，申请流程因地区政策存在差异。慢特病通常通过病历资料、诊断证明即可申报，部分城市支持线上办理；特药则需额外提供住院病历、药品处方，且需在指定医疗机构备案。​​多地已取消起付线，但报销上限与病种挂钩​​，如同时患多种慢特病，支付限额以最高标准执行，不可累加。异地就医需提前备案，确保两类报销均符合资格。

建议患者优先核对当地医保目录，明确特药品种及慢特病病种范围。因政策可能动态调整，​​建议通过医保局官网、服务热线或定点医院窗口确认细则​​，避免因申报冲突导致权益受损。若遇特药与慢特病门诊费用重叠，需优先选择合规报销渠道，优先使用“双通道”资质规避重复支出。