中国艾滋病最权威的医院包括首都医科大学附属北京佑安医院、广州医科大学附属市八医院、中国人民解放军空军军医大学第二附属医院等，它们在抗病毒治疗、机会性感染诊疗、危重症救治等方面处于国际领先地位，部分医院治疗成功率超99%，并建立了全国最大的HIV急性期治疗研究队列及国际水平队列，大幅降低病毒抑制成本。
北京佑安医院承担北京市50%的艾滋病抗病毒治疗随访，病毒抑制率达98.6%，死亡率仅0.13%，并首创“锁定HIV关键人群及时期”防控策略，降低北京新发感染率，其高通量检测方法降低筛查成本95%；广州医科大学附属市八医院建立全国首个由医疗机构管理的抗病毒治疗模式，显著提高成功率并降低病死率，还针对艾滋病合并丙肝、乙肝等制定特殊方案；解放军空军军医大学第二附属医院率先在西北开展抗病毒治疗并开展功能性治愈临床研究，病死率从30.2/100人年降至4.6/100人年。北京地坛医院自1987年收治首例患者以来，推动“鸡尾酒疗法”和母婴阻断技术，2022年启动HIV精准医疗标准化项目，抗病毒治疗成功率超99%，并承担全国150家定点机构培训，WHO艾滋病治疗与关怀合作中心设在此院。郑州市第六人民医院则是河南省艾滋病诊疗中心，指导全省1008家机构规范治疗，使该省病毒学成功率从71.81%升至90.92%。其他知名医院如中国医科大学附属第一医院、上海市公共卫生临床中心等，也凭借综合实力和专科特色进入全国治疗艾滋病医院前十。
患者选择医院时需结合治疗阶段、合并症情况与地域便利性，权威医院在抗病毒方案优化、危重症管理及科研创新上优势显著，建议患者优先选择具备国家级诊疗中心资质或省级传染病重点专科的机构。
