医保门诊和住院的起付线不一样，主要区别体现在计算方式、支付标准和报销比例三个方面。门诊起付线通常按年度累计计算，而住院起付线会随年度内住院次数逐次递减；门诊费用由医保基金按比例报销，住院起付线则需个人先行垫付。住院报销比例普遍高于门诊，且不同级别医疗机构的起付线和报销比例也存在差异。

1. 计算方式不同
   门诊起付线是一个年度内累计计算的固定金额，超过后医保才开始报销；住院起付线则根据住院次数动态调整，首次住院需全额支付起付线，后续住院时起付线会逐步降低，甚至降为零。例如，某地三级医院首次住院起付线为900元，第二次可能降至450元。

2. 支付标准不同
   门诊起付线是医保报销的门槛，超过部分由医保按比例分担；住院起付线则是医保报销前需个人全额自付的部分。例如，某次门诊费用若未达到起付线，则全部自费；而住院费用中，起付线部分需患者先行承担，超出部分才进入医保报销流程。

3. 报销比例差异
   住院报销比例通常高于门诊，尤其是高级别医院。例如，三级医院门诊报销比例可能仅55%，而同级别住院报销比例可达65%-80%。基层医疗机构（如社区医院）的门诊起付线可能更低甚至为零，报销比例更高（约65%），适合小病就医。

医保起付线因门诊和住院类型不同而存在显著差异，合理选择就医方式能有效降低医疗负担。建议根据实际需求优先考虑基层医疗机构，并提前了解当地医保政策细则。