根据最新政策，灵活就业人员退休时医保年限不足的处理方式如下：

一、补缴方式

1. 一次性补缴

   • 操作流程 ：在办理退休手续时，以退休时上年度全口径城镇单位就业人员平均工资为基数，按6.8%-8%（不同地区比例略有差异）一次性补缴不足年限。

   • 待遇享受 ：补缴后次月起可享受退休人员医保待遇，但个人账户不计入补缴费用。

   • 注意事项 ：部分地区允许按7%比例逐年缴费，直至满足年限（如西安等地）。

2. 逐年缴费

   • 操作流程 ：继续按月或按年缴费，直至累计年限达到规定（如25年）。

   • 待遇享受 ：缴费期间可享受在职职工医保待遇，补缴后次月起享受退休待遇。

二、特殊情形处理

• 视同缴费年限 ：若存在制度实施前的连续工龄，可将其计入缴费年限，减少补缴压力。

• 经济困难 ：部分地区允许申请减免或分期补缴，需咨询当地医保局。

三、注意事项

• 避免转居民医保 ：职工医保待遇（如80%报销比例）优于居民医保（约60%），建议补缴职工医保。

• 时效性要求 ：补缴截止时间通常不能晚于退休当月申报，在职转退休手续办理前需完成。

建议优先选择一次性补缴以保障退休待遇，若经济压力较大可结合逐年缴费灵活调整。具体操作以当地医保政策为准，可拨打12333或咨询医保经办部门。