药店可通过统筹医保报销的药品主要包括甲类、乙类药品及部分特殊药品，参保人需在定点药店凭合规处方购药，且甲类药全额报销，乙类药需先自付一定比例后剩余部分报销。
医保统筹药品以甲类和乙类为主，其中甲类药品（如钙片、感冒灵、六味地黄丸等）可全额纳入医保报销范围；乙类药品（如部分抗生素、慢性病用药）需个人先自付一定比例，剩余费用再报销。这类药品外包装通常标注“统筹”标识。国家谈判药品也纳入统筹范围，涵盖部分高价靶向药、抗癌药等，但需满足特定适应症条件。慢性病药物（如高血压、糖尿病药物）在符合当地政策时，可直接报销。感冒类、肠胃类、跌打损伤类等常见药物，以及中药材（如当归、三七）也在目录中，但具体报销以目录为准。非处方药中部分常规用药（如退烧药、维生素）需凭医生处方购买方可报销。需要注意，医保统筹目录与各地政策挂钩，如广东“双通道”政策允许特殊药品通过医院或药店双渠道报销，而滋补保健品、疫苗等被排除在统筹范围外。购药时务必确认药品属于医保目录内，并通过定点药店结算，甲类药品直接报销，乙类则按比例扣除后结算。药品需符合门诊用药条件，例如慢性病药物需满足本地门诊统筹政策，处方药须凭纸质或电子处方购买。未来全国推广药店统筹服务后，参保人可通过医保卡或线上平台直接结算，无需再依赖个人账户支付。
