四川泸州社保基数16400元的情况下，个人所得税扣税金额主要取决于社保缴纳比例、专项扣除等因素。根据现行税收政策，扣除社保和专项扣除后，应纳税所得额为16400元减去社保个人缴纳部分，再减去5000元基本减除费用和各项专项附加扣除。

1. 1.社保个人缴纳部分计算：养老保险：缴费基数16400元，缴费比例为8%，即16400×8%=1312元。医疗保险：缴费基数16400元，缴费比例为2%，即16400×2%=328元。失业保险：缴费基数16400元，缴费比例为0.5%，即16400×0.5%=82元。工伤保险和生育保险由单位缴纳，个人无需缴纳。总社保个人缴纳部分为：1312+328+82=1722元。
2. 2.应纳税所得额计算：扣除社保个人缴纳部分后，16400-1722=14678元。再扣除5000元基本减除费用，应纳税所得额为14678-5000=9678元。如果有专项附加扣除，如子女教育、继续教育、大病医疗、住房贷款利息、住房租金和赡养老人等，还需要进一步扣除。假设没有专项附加扣除，则9678元为最终应纳税所得额。
3. 3.个人所得税计算：根据现行个人所得税税率表，9678元应纳税所得额适用10%的税率，速算扣除数为252元。应纳个人所得税为：9678×10%-252=967.8-252=715.8元。
4. 4.综合计算：每月社保个人缴纳部分为1722元。每月个人所得税为715.8元。总扣税金额为1722+715.8=2437.8元。

四川泸州社保基数16400元的情况下，扣除社保和个人所得税后，个人实际到手的金额为16400 - 2437.8 = 13962.2元。需要注意的是，具体的扣税金额可能会因个人实际情况的不同而有所变化，例如是否有专项附加扣除等。建议根据个人实际情况进行详细计算或咨询专业税务人员。