海南琼中社保基数为10400时，扣税金额取决于多个因素，包括社保缴费比例、公积金缴费比例以及个人所得税税率。社保和公积金的个人缴费部分会从工资中扣除，剩余部分再计算个人所得税。以下是详细的计算步骤和影响因素：

1. 1.社保和公积金缴费比例：养老保险：个人缴费比例为8%，即10400元×8%=832元。医疗保险：个人缴费比例为2%，即10400元×2%=208元。失业保险：个人缴费比例为0.5%，即10400元×0.5%=52元。住房公积金：假设缴费比例为12%，即10400元×12%=1248元。
2. 2.扣除社保和公积金后的应纳税所得额：应纳税所得额=工资-社保-公积金=10400元-832元-208元-52元-1248元=8060元。
3. 3.个人所得税计算：根据中国现行的个人所得税税率表，扣除5000元免税额后，应纳税所得额为8060元-5000元=3060元。3060元适用的税率为3%，速算扣除数为0。应缴个人所得税=3060元×3%=91.8元。
4. 4.总扣税金额：总扣税金额=社保+公积金+个人所得税=832元+208元+52元+1248元+91.8元=2431.8元。

在海南琼中，社保基数为10400元时，个人需要缴纳的社保、公积金和个人所得税总额为2431.8元。需要注意的是，住房公积金的缴费比例可能因地区或单位政策不同而有所变化，实际扣税金额可能会有所调整。

为了更好地规划个人财务，建议定期关注当地社保和税务政策的变化，并根据自身情况调整财务计划。了解各项费用的具体构成和计算方法，有助于合理安排收入和支出，确保个人财务的健康和稳定。