海南保亭社保基数20900元的情况下，个人所得税的扣税金额主要取决于具体的税率和扣除项目。根据现行税法，社保基数越高，相应的应纳税所得额也会增加，从而可能适用更高的税率。 以下是对此问题的详细解析：

1. 1.社保基数与应纳税所得额：社保基数20900元是计算社保缴费和应纳税所得额的基础。社保缴费通常包括养老保险、医疗保险、失业保险等，这些缴费是税前扣除的。假设社保缴费比例为工资的20%，那么税前扣除的社保费用为20900元×20%=4180元。应纳税所得额=20900元-4180元=16720元。
2. 2.个人所得税税率：根据中国现行的个人所得税税率表，应纳税所得额在8000元至17000元之间的部分，适用税率为20%。对于16720元的应纳税所得额，其中8000元至17000元的部分为8720元，适用20%的税率。计算税额：8000元×10%+8720元×20%=800元+1744元=2544元。
3. 3.速算扣除数：为了简化计算，个人所得税还引入了速算扣除数的概念。根据税率表，速算扣除数为2520元。最终应缴税额=应纳税所得额×适用税率-速算扣除数=16720元×20%-2520元=3344元-2520元=824元。
4. 4.其他扣除项目：除了社保缴费，个人还可以享受其他税前扣除项目，如子女教育、继续教育、大病医疗、住房贷款利息、住房租金和赡养老人等专项附加扣除。假设个人有子女教育和赡养老人两项扣除，总扣除额为3000元，那么应纳税所得额将进一步减少为16720元-3000元=13720元。重新计算税额：8000元×10%+5720元×20%-2520元=800元+1144元-2520元=1944元-2520元=-576元（由于税额不能为负，最终税额为0元）。

海南保亭社保基数20900元的情况下，具体的扣税金额需要根据个人的实际情况和税前扣除项目进行详细计算。通过合理利用税前扣除项目，个人可以有效降低应纳税所得额，从而减少个人所得税的负担。