海南陵水社保基数16300元和5000元的主要区别体现在个人社保缴纳金额和社保待遇上。以下是具体的分析：

社保缴费基数的影响

• 养老保险：
  • 缴费基数为16300元时，个人缴纳金额为16300元 × 8% = 1304元。
  • 缴费基数为5000元时，个人缴纳金额为5000元 × 8% = 400元。
• 医疗保险：
  • 缴费基数为16300元时，个人缴纳金额为16300元 × 2% = 326元。
  • 缴费基数为5000元时，个人缴纳金额为5000元 × 2% = 100元。

灵活就业人员社保缴费标准

• 缴费基数及比例：
  • 陵水灵活就业社保参照职工社保的缴费基数进行缴纳，一般分为六个档次，具体为上年度在岗职工平均工资的60%、70%、80%、90%、100%、150%。
  • 缴费比例为20%，其中12%进入统筹基金，8%进入个人账户。

社保基数差异对社保待遇的影响

• 养老金：缴费基数越高，退休后可以领取的养老金也越多。100%的缴费档次缴纳灵活就业社保比60%的缴费档次缴纳灵活就业社保可以领到的钱要多。
• 医疗保险：缴费基数越高，个人缴纳的医疗费用部分也越多，但医疗保险的报销比例和范围通常也会相应提高。

海南陵水社保基数16300元和5000元在个人社保缴纳金额和社保待遇上存在明显差异，具体选择应根据个人经济状况和需求进行综合考虑。