在海南海口，社保基数为12400元时的扣税情况如下：
社保缴费比例及金额
- 养老保险：个人缴费比例为8%，即12400元 × 8% = 992元。
- 医疗保险：个人缴费比例为2%，即12400元 × 2% = 248元。
- 失业保险：个人缴费比例为0.5%，即12400元 × 0.5% = 62元。
- 工伤保险：个人不缴费。
- 生育保险：个人不缴费。
应纳税所得额计算
应纳税所得额 = 社保基数 - 社保个人缴费总额 - 免征额（5000元）。 应纳税所得额 = 12400元 - 992元 - 248元 - 62元 = 8100元。
个人所得税计算
根据现行个人所得税税率表，8100元位于第2级税率区间（超过3000元至12000元的部分，税率为10%）。 应缴税款 = 3000元 × 3% + （8100元 - 3000元） × 10% = 90元 + 510元 = 600元。
税后收入计算
税后收入 = 社保基数 - 社保个人缴费总额 - 应缴税款。 税后收入 = 12400元 - 992元 - 248元 - 62元 = 8100元。
请注意，以上计算仅供参考，实际扣税情况可能会因个人实际情况（如专项附加扣除等）而有所不同。建议根据当地最新的政策进行计算和确认。
