广东潮州社保基数9800元和5000元的主要区别体现在以下方面：

缴费金额差异

• 养老保险：以养老保险为例，若选择9800元为缴费基数，个人每月需缴纳784元（8%），单位则需缴纳1568元（16%）。而选择5000元为缴费基数时，个人每月缴纳400元，单位缴纳800元。这意味着9800元基数下的月缴费总额（2352元）明显高于5000元基数（1200元）。
• 医疗保险：医疗保险方面，9800元基数下个人每月缴纳196元（2%），单位882元（约9%），总计1078元；而5000元基数下个人和单位各缴纳500元，总计1000元。9800元基数下的医保缴费总额也高于5000元基数。

社保待遇差异

• 养老金：养老金的数额与缴费基数正相关。选择9800元基数时，由于“本人指数化月平均缴费工资”更高，基础养老金和个人账户养老金都会相应增加，从而提高退休后的养老金水平。相比之下，5000元基数下的养老金水平会低一些。
• 医保待遇：高缴费基数通常意味着医保个人账户每月划入的金额更多，这包括门诊和购药的支付能力。在一些城市中，医保的年度报销上限也与缴费基数挂钩，因此高基数可能会带来更高的年度报销额度。

长期权益影响

• 长期福利：选择较高的社保基数虽然会增加当前的缴费压力，但未来在养老金、医保报销等方面的福利水平也会相应提升。这对于追求长期稳定保障的人群来说是非常重要的。

广东潮州社保基数9800和5000的主要区别体现在缴费金额、社保待遇及长期权益方面。