广东深圳社保基数12800和5000的核心区别在于缴费金额、福利待遇及适用人群：高基数（12800）缴费更高但未来养老金、医保报销等福利更优，适合收入较高群体；低基数（5000）缴费压力小但待遇相对较低，更适合收入普通或灵活就业者。

1. 缴费金额差异
   按深圳现行比例计算，12800基数下个人每月社保缴费约12800×10.5%=1344元，单位缴纳约12800×23.2%=2969.6元；而5000基数下个人仅需5000×10.5%=525元，单位缴纳5000×23.2%=1160元。高基数每月多缴819元（个人）和1809.6元（单位）。

2. 福利待遇对比

   • 养老金：12800基数退休后月领养老金显著高于5000基数，因养老金计算与缴费基数直接挂钩。
   • 医保报销：高基数参保人医保个人账户入账更多，且部分城市对高基数者提供更高报销比例或额度。
   • 失业/工伤待遇：失业金按基数比例发放，高基数者领取金额更高；工伤赔偿同样以基数为计算基准。

3. 适用人群建议
   高基数适合长期稳定高收入人群，尤其是计划在深圳养老或注重医疗资源者；低基数更适合短期工作者、灵活就业者或收入有限群体，可减轻即时经济压力。

总结：选择社保基数需权衡当前经济能力与未来福利需求，高基数“多缴多得”但负担较重，低基数则更灵活但保障有限。建议根据收入变化定期评估调整。