根据河南省商丘市社保缴费基数9000元的情况，扣除五险一金后的个税计算如下：

一、五险一金扣除金额

1. 社保缴费部分

   • 养老保险：9000元 × 8% = 720元

   • 医疗保险：9000元 × 2% = 180元

   • 失业保险：9000元 × 0.5% = 45元

   • 公积金：9000元 × 10% = 900元

   • 工伤保险与生育保险：个人不缴费

   • 合计 ：720 + 180 + 45 + 900 = 1845元

2. 个税计算

   根据2023年最新税率表，9000元（扣除五险一金后）属于 第一档 ，适用税率3%，速算扣除数210元。 计算公式：
   $$个税 = (9000 - 5000) \times 3% - 210 = 190元$$

二、实发工资

实发工资 = 9000元 - 1845元（社保） - 190元（个税） = 6965元

三、注意事项

1. 社保基数差异 ：不同城市社保缴费基数可能不同，建议以商丘市最新政策为准；

2. 年度调整 ：社保比例可能随政策调整，需关注官方通知。

9000元工资在河南商丘扣除五险一金和个税后，实发工资约为 6965元 ，需缴纳个税 190元 。