根据2024年山东聊城社保基数20000元的情况，扣除社保及专项附加扣除后的应纳税所得额及税额计算如下：

一、基础计算

1. 应纳税所得额计算公式 $$应纳税所得额 = 月收入 - 5000元（起征点） - 三险一金 - 专项附加扣除 - 其他依法扣除$$

   其中，三险一金包括养老保险、医疗保险、失业保险及住房公积金。

2. 基础税额

   月薪20000元，扣除起征点5000元后，应纳税所得额为15000元，对应税率20%，速算扣除数1410元，基础税额为1590元。

二、实际扣税金额的影响因素

1. 社保及专项附加扣除

   • 社保费用 ：需扣除个人缴纳部分（养老保险8%、医疗保险2%、失业保险0.5%、住房公积金5%-12%）及单位缴纳部分。

   • 专项附加扣除 ：包括子女教育、继续教育、大病医疗、住房贷款利息或住房租金、赡养老人等，具体额度根据家庭情况确定。

2. 其他依法扣除

   包括捐赠支出等符合税法规定的抵税项目。

三、示例计算（假设情况）

假设个人缴纳社保比例为8%，专项附加扣除为2000元：

1. 社保扣除 ：20000元 × 8% = 1600元

2. 应纳税所得额 ：20000 - 5000 - 1600 - 2000 = 11400元

3. 应纳税额 ：11400 × 20% - 1410 = 1370元

实际税额 ：1590元（基础税额） - 1600元（社保） + 2000元（专项附加扣除） = 1990元 （需注意专项附加扣除不得超过当年应纳税所得额）。

四、注意事项

1. 专项附加扣除标准 ：子女教育、住房贷款利息等扣除额度有明确上限，需结合家庭实际情况申报。

2. 年度汇算清缴 ：实际税额以年度汇算结果为准，多退少补。

3. 政策调整 ：社保比例及专项附加扣除标准可能随政策调整，建议每年关注最新规定。

如需精确计算，建议提供具体社保缴纳比例及专项附加扣除项目。