山东枣庄社保基数设定为9900和5000的主要区别在于缴费金额、个人负担及未来养老金待遇的不同。高基数意味着更高的缴费，但同时也可能带来更优厚的退休福利。

在山东枣庄，社保基数直接影响到职工每月需要缴纳的社会保险费用。基数越高，个人和单位所需缴纳的养老保险费用就越多，因为养老保险的缴费比例是基于选定的基数来计算的。例如，如果选择9900作为基数，按照8%的个人缴费比例，每月需缴纳792元；而以5000为基数，则只需缴纳400元。

医疗保险的缴费也会有所不同。医疗保险的个人缴费比例通常为2%，基数为9900时，个人需缴纳198元；若基数为5000，则个人部分为100元。这意味着较高的基数将导致每月从工资中扣除更多的资金用于社会保险。

较高的社保基数还会影响未来的养老金待遇。由于养老金的计算与个人账户的累计储存额密切相关，较高的缴费基数有助于增加个人账户中的积累，从而在未来提供更高的养老金收入。这使得选择较高的社保基数对于长期规划而言显得尤为重要。

选择9900还是5000作为社保基数，取决于个人当前的经济状况以及对未来养老保障的需求。较高的基数虽然短期内增加了个人支出，但从长远来看，它能为退休后的生活提供更为稳固的经济支持。建议根据自身的实际情况作出合理的选择，并考虑到可能影响最终养老金水平的各种因素。