江西新余社保基数6400元和5000元的主要区别体现在缴费金额、社保待遇及适用人群等方面，具体如下：

缴费差异

• 6400基数：每月个人与单位合计缴费金额会更高，因为基数越高，需要缴纳的社保费用越多。具体金额需要根据当地社保缴费比例计算，但一般来说，养老保险个人缴费比例为8%，单位缴费比例为16%。如果按照6400元作为缴费基数，个人需要缴纳的部分为6400×8%=512元，单位需要缴纳的部分为6400×16%=1024元。
• 5000基数：每月个人与单位合计缴费金额相对较低，同样以养老保险为例，个人需要缴纳的部分为5000×8%=400元，单位需要缴纳的部分为5000×16%=800元。

待遇影响

• 养老金：缴费基数越高，个人账户累积额越大，退休后每月领取的养老金也相应更高。因为养老金的计算公式中，个人账户储存额是一个重要因素。
• 医保报销：医保报销比例通常与缴费基数无关，但基数越高，医保个人账户的入账金额可能会相应增加。不过，这并不影响医保的报销比例和上限。

适用建议

• 高收入者：如果个人收入较高，可以选择6400元作为缴费基数，以匹配工资水平并提升未来福利。
• 收入有限或灵活就业者：如果个人收入有限或者选择灵活就业，5000元的缴费基数可能更为合适，可以在平衡当前支出与基础保障之间找到一个平衡点。

请注意，以上内容仅供参考，具体的缴费金额和待遇可能会因政策调整而有所变化。为了确保个人权益，建议定期查询最新的社保缴费标准和待遇信息。